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クラッシュ操作 | ミュータント操作 | ボス操作
基本操作
| 移動 | アナログスティック |
| バウンシィ・バウンシィ（ジャンプ） | × |
| エアジャンプ（ダブルジャンプ） | ×× |
| ハイジャンプ | アナログスティックを一回転（スピンアタック）して× |
| バックフリップ | アナログスティックを進行方向の逆に倒し× |
| ライトアタック | □ |
| スピンドリルアタック | 空中で□（×□） |
| ヘヴィアタック | △ |
| チャージアタック | △押しっ放し |
| カウンターアタック | ミュータント戦の時に、表示が出たら△ |
| スピンアタック | アナログスティックを一回転して□連打 |
| ジャック/アンジャック | ミュータントが気絶中に○/ミュータントに乗っている時に○ |
| ミュータントの出し入れ・Ａ | ○押しっ放し |
| ミュータントの出し入れ・Ｂ | ガード中（Ｒボタン押しっ放し）+○ |
| ガード | Ｒボタン |
地図操作
| 地図＆MISSION確認 | SELECTボタン |
| 地図拡大 | Ｒボタン |
| 地図移動 | Ｒボタン押しっ放し＋アナログスティック |
| 地図角度 | Ｒボタン押しっ放し＋十字キー |
コンボ/技
| パンチ | □ |
| パンチパンチ | □□ |
| ノーリス・ラウンドハウス | □□□ |
| チェインティックラー | □□△ |
| ボードスラム | □□△△ |
| ローリングキック（溜め可） | △（溜め可） |
| ダブルワーミー（溜め可） | △△（溜め可） |
| トリプルドラゴン（溜め可） | △△△（溜め可） |
| オールドスクール（スピンアタック） | アナログスティックを一回転して□連打 |
| ジャイロジャックハマー | アナログスティックを一回転して△ |
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